Die Anbindung von Klosterneuburg an Wien erfolgt ausschließlich über die Franz-Josefs-Bahn. Das betrifft auch den Busverkehr, der parallel zur S40 verläuft und in Heiligenstadt endet. Das Angebot soll um Verbindungen nach Wien Handelskai ergänzt werden. Die Gleisinfrastruktur ist grundsätzlich vorhanden und müsste eventuell erweitert werden.

Die Anbindung an Wien Handelskai über Regionalzüge schließt eine Lücke im Regionalzugnetz. Eine S-Bahn-Verbindung würde Klosterneuburg wesentlich attraktiver an das linke Donauufer anbinden. Außerdem gelangt man mit nur einem Umstieg von der Franz-Josefs-Bahn zum Flughafen Wien-Schwechat und in das südliche Wiener Umland.

Das Angebot nach Wien Franz-Josefs-Bahnhof soll grundsätzlich erhalten bleiben. Die Häufigkeit der Verbindungen bleibt erst mal offen.