Um die Knotenfunktion des Naumburger Hauptbahnhofes zu verbessern, sollten hier die Hauptgleise so geführt sein, dass diese getrennt jeweils einen Bahnsteig mit einem Nebengleis anfahren. 

1.  durchfahrende Züge Süd-Nord und Ost-West können so schneller korrespondieren und einen ITF bilden (sehr enges Gefüge nach Jena, Leipzig und Halle): IC Saalbahn – RE/SE Thüringer Bahn
2. endende Stadtschnellbahnlinien aus Halle/Leipzig sowie RB-Linien aus Süd/West teilen sich Gleis 1
3. um nötige Gruppenausfahrten zu realisieren und nicht das Gegengleis zu blockieren (sehr ungünstig bei verspäteten Gegenverkehr) und mehr Güterverkehrstrassen sollte ein drittes Gleis zwischen Saaleck und Großkorbetha wieder reaktiviert werden

Weiterhin ist eine weitere Unterführung in Bahnsteigmitte nötig, um schnelle Übergänge zu den anderen Zügen zu ermöglichen. Ein Ausgang zur Brückenstraße verkürzt die Wege vor allem für Radler ins/aus dem Unstruttal zum Zug.

Naumburg kann so als Nullknoten aufgebaut werden und attraktive Übergänge herstellen, die vor allem den IC der Saalbahn stärken.