Die X3 hat die Besonderheit, dass sie nicht auf beiden Linienästen mit beschleunigtem Haltemuster verkehrt. Im Westen ist diese sogar langsamer als die 1, weil sie den Umweg über das Krankenhaus Friedrichstadt fährt. Außerdem variiert der westliche Ast, weil hier je nach Bedarf entweder die Messe oder die neu zu errichtende P+R-Anlage in am Hp Kemnitz angefahren wird. Diese soll auf Stelzen über der Bahnstrecke und unter der Autobahn gebaut werden.

Östlich des Zentrums verkehrt die X3 bis zum Fetscherplatz parallel zur X1 und biegt dann in Richtung Universitätsklinikum ab. Durch das Auslassen von Haltestellen und die Nutzung der Neubaustrecke in der Pillnitzer/Striesener Straße entsteht eine Fahrzeitverkürzung von 9 Minuten im Vergleich zur 12. Diese und die 6 sollen auf Viertelstundentakt ausgedünnt werden, damit die X3 nicht hinter einer dieser Bahnen her fahren muss. Allerdings verliert Blasewitz dabei keine Verbindungen, weil für die vier wegfallenden anderen Bahnen vier X3 pro Stunde geführt werden.

Danach wird die Expresslinie nach Loschwitz weiter geführt, um nicht fast bis ganz leer nach Tolkewitz fahren zu müssen. Dabei wird der Abschnitt auf dem Blauen Wunder eingleisig und auf einem besonderen Bahnkörper in der Mitte der Brücke ausgeführt. Das wäre an der Stelle, wo sich heute die dritte Autospur befindet.