Beschreibung des Vorschlags
Die S 1 von Villingen bis Breisach benötigt mit allen Halten 2 h 15 min, wenn sie die gesamte Strecke fährt. Jedoch wird die Strecke auf zwei Linien aufgeteilt, was eine zusätzliche Wartezeit von 30 Minuten bedeutet. Eine Linie, die zwar nur die wichtigsten Haltestellen auf der Strecke abdeckt, dafür aber schneller fahren und dadurch Zeit einsparen kann, klingt also sinnvoll. Zusätzlich würde es den Verkehr entzerren, da die S 10 nach Villingen bis Titisee immer sehr voll ist, trotz dass jede halbe Stunde ein Zug in diese Richtung fährt und umgekehrt könnte es Menschen aus Breisach oder Villingen dazu ermutigen, statt dem Auto den Zug zu nutzen, da dieser nun schneller in Freiburg ankommt.
Zusätzlich habe ich gedacht, dass man die Gleise bei Breisach über den Rhein erweitern und der RE und die S-Bahn bis nach Colmar fahren könnte, wodurch eine bessere Verbindung mit dem französischen Nahverkehr und eine direkte Verbindung zwischen Colmar und Freiburg gegeben wäre. Diese Brücke hat in der Vergangenheit bereits existiert und wurde durch den Krieg zerstört, weshalb auch in Frankreich immer noch Gleise existieren, die dieses Projekt vereinfachen würden und noch dazu nach dem deutschen Richtungsprinzip gebaut wurden.
Der RE muss auch nicht zwangsläufig stündlich fahren, sondern kann auch nur alle zwei Stunden fahren oder nur zu benötigten Uhrzeiten fahren (Siehe S5/RE 5 zwischen Eppingen und Heidelberg).
An den Bahnhöfen, die mit einem R gekennzeichnet wurden, soll der Zug halten. Bei den Bahnhöfen, die mit einem grauen Punkt gekennzeichnet sind, bin ich mir nicht sicher, ob der RE dort auch halten sollte oder ob sie eher überflüssig wären.
Auch wenn für einen RE oder allgemein eine höhere Auslastung der Strecke diese zweigleisig gemacht werden müsste, könnte dies möglicherweise auch Vorteile haben, wie das Einrichten einer weiteren S-Bahn-Linie östlich von Neustadt, die diesen Ort ab Villingen oder Donaueschingen mit ganz anderen Orten verbindet als die S 10. Ich weiß auch, dass es bei einigen Abschnitten im Höllental schwer (Tunnel) bis unmöglich (Viadukt) ist, die Gleise zweigleisig zumachen, jedoch könnte man Versuchen, die Eingleisigkeit zu minimieren und die größeren Abschnitte dazwischen zweigleisig zu machen. Das Selbe gilt auch für Bahnhöfe zwischen Neustadt und Donaueschingen, sowie stillgelegte Bahnhöfe im Höllental, diese könnten als Kreuzungsbahnhöfe dienen, wenn es nicht möglich ist, Streckenabschnitte zweigleisig auszubauen, diese aber nun rechnerisch den üblichen Kreuzungspunkt zweier Züge darstellten.
PS. Der RE 1 von Freiburg nach Schluchsee war nicht ganz nach meinem Gedanken, da er fast keine Haltestellen auslässt und sogar kürzer ist als die S1 (als sie noch bis Freiburg gefahren ist). Dieser Zug bringt die Passagiere nicht einfacher und wahrscheinlich auch nicht schneller nach Schluchsee als die frühere S1.

Finde ich eine tolle Idee die beiden Städte zu verbinden.
Wie wäre es mit einem Tram-Train? Colmar hatte mal eine Straßenbahn, die sich recht leicht wiederaufbauen lasse. Müsste halt nach Breisach direkt über Merdingen führen und an der Haltestelle Bollerstaudenstraße an das Straßenbahnnetz von Freiburg anschließen. Der andere Streckenteil müsste auf Meterspur umgebaut werden.
Die Strecke zwischen Breisach und Freiburg existiert bereits als S-Bahnlinie, also Zuggleise. Die DB müsste sich also dafür Fahrzeuge beschaffen, die sowohl auf Straßenbahn-Gleisen als auch auf Zuggleisen fahren kann. Dieses Prinzip kenne ich bisher nur aus zwei Städten in Baden-Württemberg (Karlsruhe und Heilbronn) und solche Fahrzeuge sind in der Beschaffung sicherlich teurer als gewöhnliche Straßenbahnen oder S-Bahnen. Außerdem ging es um den Ausbau bzw. die Erweiterung der Zuggleise von Villingen über Freiburg und Breisach bis nach Colmar und das Schaffen einer Expresslinie von Villingen bis Colmar. Von einer Linie, die die Straßenbahnen von Freiburg und Colmar verbindet war nie die Rede, das wäre ein anderes Projekt, auch wenn es sich überschneidet (Könntest du ja erstellen).
Zudem macht der Abschnitt Freiburg-Colmar wahrscheinlich nur ein Drittel oder Viertel der Strecke aus, die Funktion auf Straßenbahngleisen zufahren, wäre also wahrscheinlich überflüssig oder fast ungenutzt, wenn der Zug bis nach Villingen durchfährt, wo nur Zuggleise verlegt sind. Auch bin ich mir nicht sicher, ob es Tram-Trains gibt, die über die Durchschnittsgeschwindigkeit einer S-Bahn/Regional-Bahn hinaus beschleunigen können und für einen Regionalexpress geeignet wären (o.k. einige REs sind oft nur S-Bahnen, die zweitrangige Haltestellen auslassen, jedoch können sie dadurch kurzzeitig über den Durchschnitt hinaus beschleunigen).
Die Höllentalbahn ist komplett eingleisig, wie soll die den zusätzlichen Verkehr aufnehmen? Das müsstest du hier schon noch ausführen.
Neben dem stillgelegten Bahnhof Hirschsprung, der als Kreuzungspunkt reaktiviert wurde, gibt es im Höllental noch mindestens zwei weitere stillgelegte Bahnhöfe, die auch als Kreuzungs- oder Überholpunkt genutzt werden können. Zudem ist das Gelände vom Viadukt bis zur Haltestelle Hirschsprung nicht felsig bzw. nur einseitig felsig, hier könnte die Strecke über mindestens einen Kilometer zweigleisig gemacht werden. Die Strecke von Himmelreich bis Freiburg sowie von Freiburg nach Breisach könnte auch ohne große Probleme zweigleisig gemacht werden (möglichweise auch schon in Falkensteig, nicht erst in Himmelreich).
Das selbe gilt auch für den Abschnitt von Hinterzarten bis Donaueschingen. Von Hinterzarten bzw. Ende des Höllentals bis nach Neustadt (und noch etwas weiter) wäre ein vergleichsweise einfacher zweigleisiger Ausbau der Strecke möglich. Auf der Strecke Neustadt bis Donaueschingen gibt es zwar auch Abschnitte, die zu schmal/steil für ein zweites Gleis wären, jedoch gibt es auch hier Bahnhöfe mit zwei Gleisen bzw. Platz für ein zweites Gleis hätten und kurze Abschnitte, die breitgenug für ein zweites Gleis wären.
Stellen, an denen der RE das Gleis kurzzeitig wechseln und die S-Bahn überholen oder ihr entgegenkommen könnte, würde es also eigentlich genug geben, man müsste sie nur ausbauen.